創立年は享保年間(1716年～1736年)と推定される。境内の最古の灯籠2基に延享4年(1747年)建設とある。
古文章に『正一位十二神社大明神天神七代地神五代』とあり、合計十二柱の神々を総称して十二神社としたのであろう。
神世七代の最後に成れる神である伊邪那岐命と伊邪那美命が、その代表として主祭神に奉斎されたと考える。